[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-008075
Length:
1,789
Sequence:
[FASTA format sequence]
GTTCCCCGGG CGGGTGGCGG CGCTCGGCCT CGCACTTCCG GGAGGAGGAA TCCCAAGCGC
CCGCTACGAG CCTCAGCCCT GGGGTCCGGC GAACCGTGTA TGCAGTGGAT CATGGAGCGG
GTCGGCTCAG GCCACCAGCC CCTTAGGTGA GGACAGTGCC TGGGGCTCAG CAGACAGTCC
TGGATCATGG AGGCCGAGAG CGCGCCAGCC GGGAGACTTT CCTGTTGAGA GTCGTGGGCC
CAGCTTGGCC GGCCGTCTTC AGGAGAGGCG CCGCCCCCAC GGACCAGAGC TGGGGAGCTG
CCGCTTCCGC GGATGGGGAG GTGGGCCCTC GACGTGGCCT TCCTGTGGAG GGCGGTGTTG
ACGCTGGGGC TGGTCCTTCT CTACTACTGC TTCTCCATCG GCATCACCTT CTACAACAAG
TGGCTGACCA AGAGCTTCCA CTTCCCCCTG TTCATGACGA TGCTGCACCT GGCCGTGATC
TTCCTGTTCT CCGCCCTGTC GCGGGCCCTG GTTCAATGCT CCAGCCACAG GGCCCGCGTG
GTGCTCAGCT GGACCGACTA CCTCAGAAGA GTAGCTCCCA CAGCACTGGC GACAGCGCTC
GACGTGGGCT TGTCCAACTG GAGCTTCCTC TATATCACCG TCTCGCTGTA CACAATGACC
AAGTCCTCGG CTGTCCTCTT CATCCTGATC TTCTCTCTGA TCTTCAAGCT GGAGGAGCTG
CGAGCGGCGC TGGTCTTGGT GGTTCTCCTC ATCGCCGGAG GCCTCTTCAT GTTCACCTAC
AAGTCCACGC AGTTCAACGT CGAGGGCTTT GCCTTGGTGC TGGGTGCCTC GTTCATCGGC
GGCATTCGCT GGACCCTCAC CCAGATGCTC CTGCAAAAGG CGGAACTTGG GCTCCAGAAC
CCCATCGACA CCATGTTCCA CCTGCAGCCA CTCATGTTTC TGGGGCTGTT CCCTCTCTTT
GCTGTATTTG AAGGTCTCCA TTTGTCCACA TCTGAGAAAA TCTTCCGTTT CCAGGACACC
GGGCTGCTCC TGCGGGTTCT GGGGAGCCTC TTCCTTGGCG GGATTCTCGC CTTTGGTTTG
GGCTTCTCCG AGTTCCTCCT GGTCTCCAGA ACCTCCAGCC TCACTCTCTC CATTGCCGGC
ATTTTTAAGG AAGTCTGCAC TTTGCTGTTG GCAGCTCATC TGCTGGGCGA TCAGATCAGC
CTCCTGAACT GGCTGGGCTT CGCCCTCTGC CTCTCGGGGA TATCCCTGCA CGTGGCCCTC
AAAGCCCTGC ACGCCCGAGG TGATGGCGCC CCTAAGTCCC TGAAAGGGCT GGGCTCCAAC
CCCGACCTGG AGCTCCTGCT CCGGACCAGC CAGCCGGACG AGGAGGACAA CGAGGAGGAG
TACTTTGTGG CCCAGGGGCA GCAGTGACCA GCCAGGGCAC CAGCTTAGAA GCAGGCCACT
CCCCAACCTT AACACGCCTC GGCCGCTCCG GGACCAGTAG CCTGTCGGGG GAGCAGGGGG
CCCGGCGCCT CCCGGGCTGG GCCTCGGAGA GCACGTGACC GCGCGGTGGT GGTACCAGGG
TAGGGAGCTG CTCAAATGGG TGAGCCCCGG GGCGGCCTCT CGGAGCTGCC CGGGGCAGGG
GCCCAAGCTG TGCTGGCGTC ACAGCCGGGC ACGGGAGTGG GCTGTTCTCA GCCGCCCGCC
CGGGCCCGGA AGCCAAGATG GTGATTTGCA GTTCTGACCG GTTGCTAAGG GGACAGGGTG
TGGACTGCCC AACGTTATAA ATGGGGGATG GAAACGCTGG GGCCCGGTC
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | SLC35C2 | solute carrier family 35 member C2 isoform a [Homo sapiens]. | 536 | e-152 | O |
|
| SLC35C2 | solute carrier family 35 member C2 isoform a [Homo sapiens]. | 536 | e-152 | O |
|
| SLC35C2 | solute carrier family 35 member C2 isoform b [Homo sapiens]. | 517 | e-146 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Slc35c2 | solute carrier family 35 member C2 [Mus musculus]. | 531 | e-151 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC609863 | PREDICTED: similar to ovarian cancer overexpressed 1 isoform a isoform 1 [Canis familiaris]. | 536 | e-152 | O |
|
| LOC609863 | PREDICTED: similar to ovarian cancer overexpressed 1 isoform b isoform 4 [Canis familiaris]. | 517 | e-146 | O |
|
| LOC609863 | PREDICTED: similar to ovarian cancer overexpressed 1 isoform a isoform 3 [Canis familiaris]. | 515 | e-146 | O |
|
| LOC609863 | PREDICTED: similar to solute carrier family 35, member C2 isoform 2 [Canis familiaris]. | 225 | 9e-59 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| SLC35C2 | solute carrier family 35 member C2 [Bos taurus]. | 463 | e-130 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| SLC35C2 | solute carrier family 35, member C2 [Sus scrofa]. | 560 | e-159 | O |
|
| LOC100622831 | PREDICTED: solute carrier family 35 member C2-like [Sus scrofa]. | 84.3 | 2e-16 | O |
|
Assembly Members: 18
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20110601C-008075 : ............................................................
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 0
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TES01_0095_C03.b :
PST01_0041_A07.b :
THY01_0094_G08.b : tgcacggcccaaacgtcttgtgxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
OVR01_0020_C12.b : ttggggtggacxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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PST01_0035_D02.b :
HTMT1_0111_H03.b : ttttggatgg
BMWN1_0037_H04.b : ttttgg
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20110601C-008075 : .....GTTCCCCGGGCGGGTGGCGGCGCTCGGCCTCGCACTTCCGGG*AGGAGGAATCCC
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HTMT1_0111_H03.b : tacgcggccgtaxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxGGAGGAATCCC
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SPL01_0038_H08.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxTCCC
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ADR01_0102_D06.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
TES01_0095_C03.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
PST01_0041_A07.b : *AGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
THY01_0094_G08.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
OVR01_0020_C12.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
LNG01_0056_C02.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
PST01_0035_D02.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
HTMT1_0111_H03.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
BMWN1_0037_H04.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
SPL01_0038_H08.b : AAGCGCCCGCTACGAGCCTCAGCCCTGGGGTCCGGCGAACCGTGTATGCAGTGGATCATG
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OVR01_0020_C12.b : CAGTCCTGGATCATGGAGGCCGAGAGCGCGCCAGCCGGGAGACTTTCCTGTTGAGAGTCG
LNG01_0056_C02.b : CAGTCCTGGATCATGGAGGCCGAGAGCGCGCCAGCCGGGAGACTTTCCTGTTGAGAGTCG
PST01_0035_D02.b : CAGTCCTGGATCATGGAGGCCGAGAGCGCGCCAGCCGGGAGACTTTCCTGTTGAGAGTCG
HTMT1_0111_H03.b : CAGTCCTGGATCATGGAGGCCGAGAGCGCGCCAGCCGGGAGACTTTCCTGTTGAGAGTCG
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LNG01_0056_C02.b : TGGGCCCAGCTTGGCCGGCCGTCTTCAGGAGAGGCGCCGCCCCCACGGACCAGAGCTGGG
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HTMT1_0111_H03.b : TGGGCCCAGCTTGGCCGGCCGTCTTCAGGAGAGGCGCCGCCCCCACGGACCAGAGCTGGG
BMWN1_0037_H04.b : TGGGCCCAGCTCGGCCGGCCGTCTTCAGGAGAGGCGCCGCCCCCACGGACCAGAGCTGGG
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PCT01_0020_F07.b : TGGGCCCAGCTCGGCCGGCCGTCTTCAGGAGAGGCGCCGCCCCCACGGACCAGAGCTGGG
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OVR01_0020_C12.b : GAGCTGCCGCTTCCGCGGATGGGGAGGTGGGCCCTCGACGTGGCCTTCCTGTGGAGGGCG
LNG01_0056_C02.b : GAGCTGCCGCTTCCGCGGATGGGGAGGTGGGCCCTCGACGTGGCCTTCCTGTGGAGGGCG
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BMWN1_0037_H04.b : GAGCTGCCGCTTCCGCGGATGGGGAGGTGGGCCCTCGACGTGGCCTTCCTGTGGAGGGCG
SPL01_0038_H08.b : GAGCTGCCGCTTCCGCGGATGGGGAGGTGGGCCCTCGACGTGGCCTTCCTGTGGAGGGCG
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LVRM1_0196_G10.b :
ITT01_0004_G06.b :
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PST01_0035_D02.b : GTGTTGACGCTGGGGCTGGTCCTTCTCTACTACTGCTTCTCCATCGGCATCACCTTCTAC
HTMT1_0111_H03.b : GTGTTGACGCTGGGGCTGGTCCTTCTCTACTACTGCTTCTCCATCGGCATCACCTTCTAC
BMWN1_0037_H04.b : GTGTTGACGCTGGGGCTGGTCCTTCTCTACTACTGCTTCTCCATCGGCATCACCTTCTAC
SPL01_0038_H08.b : GTGTTGACGCTGGGGCTGGTCCTTCTCTACTACTGCTTCTCCATCGGCATCACCTTCTAC
PBL01_0084_H11.b : GTGTTGACGCTGGGGCTGGTCCTTCTCTACTACTGCTTCTCCATCGGCATCACCTTCTAC
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OVR01_0020_C12.b : AACAAGTGGCTGACCAAGAGCTTCCACTTCCCCCTGTTCATGACGATGCTGCACCTGGCC
LNG01_0056_C02.b : AACAAGTGGCTGACCAAGAGCTTCCACTTCCCCCTGTTCATGACGATGCTGCACCTGGCC
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SPL01_0038_H08.b : AACAAGTGGCTGACCAAGAGCTTCCACTTCCCCCTGTTCATGACGATGCTGCACCTGGCC
PBL01_0084_H11.b : AACAAGTGGCTGACCAAGAGCTTCCACTTCCCCCTGTTCATGACGATGCTGCACCTGGCC
PCT01_0020_F07.b : AACAAGTGGCTGACCAAGAGCTTCCACTTCCCCCTGTTCATGACGATGCTGCACCTGGCC
LVRM1_0196_G10.b : xxxxxxxx
ITT01_0004_G06.b :
SKNB1_0061_G07.b :
OVR01_0069_H11.b :
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 534
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PST01_0035_D02.b : AGGACACCGGGCTGCTCCTGCGGGTTCTGGGGAC*CCTCTCCCTGGCGGGATTCTCGCCT
HTMT1_0111_H03.b : ccgggttgccctgggggttttggggaactcctccttggggggatcctcccttttggttgg
BMWN1_0037_H04.b : cggggtgctccgggggttttggggaaccccttcctgggggaatccccctttggtttgggc
SPL01_0038_H08.b : tccagaaccccggggctgcttcctggcgggttctgggggaacctcttttcttgggcggga
PBL01_0084_H11.b : A*GACACCGGGCTGCTCCCTGCGGTTCTGGGGAGCCTCTTCCTggcgggatcctcccttt
PCT01_0020_F07.b : GGGACACGGGGCTGCTCCTGgggttctggggaacctcttcctggcggggatcccgcctgt
LVRM1_0196_G10.b : AGGACACCGGGCTGCTCCTGCGGGTTCTGGGGAGCCTCTTCCTTGGCGGGATTCTCGCCT
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1132
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OVR01_0020_C12.b : cctttggggggggattccttccccctttttggttttgggctttttttcccaaagtttccc
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PST01_0035_D02.b : TTTGGTTGGGCTTCTCCGAGTTCCTCCTGGTCTCCAGAACtccgccctcctctctccatg
HTMT1_0111_H03.b : gcttcccgaattccccgggtcccaaaacccccccctcctcccctcttgcggtatttttag
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