[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-012355
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3,220
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[FASTA format sequence]
GAAGATTAAA GAGCGCGAGG AGATCTCACA GACCAGTGGA ATAAAGGCCT TTTGCATATG
AGGATCAGGT GACAAGTTAA CTGGCTACCA ACCTCCAAAG CAATTCGCCC TTTCATGTCA
CACAAAAAGA AGTGTTAAGG ATTGCCCTTT GAGACACTGA AGGCTAAAGA CTGCCTGAAG
TTACATTTAG AGACTGAAAT CACTGCACCT TAAAAACAAA AGATTGAGCT GCACTGCATT
CCTAATGTTT CACCGTCACT AACTGGATAT TCCTCGCAAC ATTGCTGTCT GGCCTGGCCT
CTCATGACCA GAGACTGCTG ACTCATCCTG GCCTGTGCCA AGCTGTGCAG TCGCTTAGCG
ATGTGGACAG GAGTCGAAGG ACTAGAATGA GATCACTGAA CTCATTTCAC TTGTTGCTTA
CGGTACAGTC CAGCATGAGC TGGAAATGTA GGAACCTCAG CCTCCCGAGC AGAAAGAGTC
CTTGACCATC AGTCTGTGGC CTGCCCCTTC TGTTTATATG CAGCCTCTCT CTGTTCCCTG
CCCCAATGAA CATCTGCACT AGGCCCAAGT CTTGGAGTGA TTTACCTGAA GAGTGACACC
ATTTATTTGA GAACTACTGA AGAAACCCAA GACAGCTGAA AACCAGAAGG CATCTGAGGA
GAATGAGATT ACTCAGCCGG GTGGATCCAG CGCCAAGCCG GGCCTTCCCT GCCTGAACTT
TGAAGCTGTT TTGTCTCCAG ACCCAGCCCT CATCCACCCA ACACATTCAC TGACAAACTC
TCACGCTCAC ACCGGGTCAT CTGATTGTGA CATCAGTTGC AAGGGGATGA CCGAGCGCAT
TCACAGCATC AACCTTCACA ACTTCAGCAA TTCCGTGCTC GAGACCCTCA ACGAGCAGCG
CAACCGTGGC CACTTCTGTG ACGTGACGGT GCGCATCCAC GGGAGCATGC TGCGCGCGCA
CCGCTGCGTG CTGGCAGCCG GCAGCCCCTT CTTCCAGGAC AAGCTGCTGC TGGGCTACAG
CGACATCGAG ATCCCGTCCG TGGTGTCGGT GCAGTCGGTG CAAAAGCTCA TTGACTTCAT
GTACAGCGGA GTGCTGCGCG TCTCACAGTC CGAAGCCCTG CAGATCCTCA CGGCCGCCAG
CATCCTGCAG ATCAAAACGG TCATCGATGA GTGCACGCGC ATCGTGTCGC AGAACGTGGG
CGATGTGTTC CCGGGGATCC AGGACTCGGG CCAGGACACG CCCCGGGGCA CACCCGAGTC
GGGCACCTCG GGCCAGAGCA GCGACACCGA GTCAGGCTAC CTGCAGAGCC ACCCGCAGCA
CAGCGTGGAC AGGATCTACT CGGCGCTCTA CGCCTGCTCC ATGCAGAACG GCAGCGGCGA
GCGCTCCTTC TACAGCGGCG CAGTGGTCAG CCACCACGAG ACTGCACTCG GCCTGCCCCG
CGACCACCAC ATGGAAGACC CTAGCTGGAT CACGCGTATC CACGAGCGCT CGCAGCAGAT
GGAGCGCTAC CTGTCCACCA CCCCCGAAAC CACGCACTGC CGCAAGCAGC CCCGGCCCGT
GCGCATCCAG ACCCTGGTGG GCAACATCCA CATCAAGCAG GAGATGGAGG ACGACTACGA
CTACTACGGG CAGCAAAGGG TGCAGATCCT GGAGCGCAAC GAGTCCGAGG AATGCACGGA
AGACACCGAC CAGGCTGAGG GCACCGAGAG TGAGCCCAAG GGCGAAAGCT TTGACTCAGG
CGTCAGCTCC TCCATAGGCA CCGAGCCCGA CTCCGTGGAG CAGCAGTTCG GGCCCGCGGC
GGCGCGGGAC GGTCCAGCCG AACCCGCCCA ACCTGAGCAG GCCGCGGAAG CCCCGGCTGA
GGGCGCCCCG CAGCCGCACC AGCTGGAGAC GGGTGCCTCT TCCCCGGAGA GAAGCAACGA
AGTGGAGATG GACAACACGG TGATCACCGT CAGCAACAGC TCCGACAAGA GCGTCCTGCA
GCAGCCCTCG GTCAACACGT CCATCGGGCA GCCATTGCCA AGTACCCAGC TCTATTTACG
CCAGACAGAA ACCCTCACCA GCAACTTGAG GATGCCTCTG ACCTTAACCA GCAACACACA
GGTCATTGGC ACCGCCGGCA ACACCTACCT GCCGGCCCTC TTCACTACCC AGCCCGCGGG
CAGCGGCCCC AAGCCTTTCC TCTTCAGCCT GCCACAGCCC CTGGCAGGCC AGCAGACCCA
GTTTGTGACA GTGTCCCAGC CCGGCCTGTC AACCTTTACT GCACAGCTGC CAGCGCCACA
GCCCCTGGCT CCATCCGCCG GCCACAGCAC AGCCAGTGGG CAGGGCGAAA AAAAGCCTTA
TGAGTGCACT CTCTGCAACA AGACTTTCAC CGCCAAACAG AACTACGTCA AGCACATGTT
CGTACACACA GGTGAGAAGC CCCACCAATG CAGCATCTGC TGGCGCTCCT TCTCCTTAAA
GGATTACCTT ATCAAGCACA TGGTGACACA CACAGGGGTG AGGGCGTACC AGTGCAGTAT
CTGCAACAAG CGCTTCACCC AGAAGAGCTC TCTCAACGTG CACATGCGCC TCCACCGGGG
CGAGAAGTCC TACGAGTGCT ACATCTGCAA AAAGAAGTTC TCCCACAAGA CCCTCCTGGA
GCGACACGTG GCCCTGCACA GTGCCAGCAA CGGGACCCCT CCCGCGGGCA CACCCCCAGG
GGCCCGCGCT GGCCCCCCAG GGGTGGTGGC CTGCACGGAG GGGACCACTT ACGTCTGCTC
CGTCTGTCCA GCAAAGTTTG ACCAAATCGA GCAGTTCAAC GACCACATGA GGATGCATGT
GTCTGACGGA TAAGTAGTAT CTTTCTCTCT TTCTTATGAA CAAAACCACA AAAAGAAAAC
AAACAAAAAA AGCTATGGCA CTAGAATTTA AGAAATGTTT TGGTTTCGTT TTTACTTTCT
GTTTTTGTTT TTTGTTCCGT TTCATTTTGT ACTACATGAA AAAACGTTTT TTTGCCTGCT
GGTACATTAC ATTTCCGGGA AGCTCGGGGG AAAACGGGGT GTTCTCCCCA ACCTCGCCTC
CGAAAGGGGG GGCCCTAAAG GGCCGGGGTA TGGCTTCCAA GGAAGGCCCA CCTGGGTTTG
GGATTCCCCC AACCTACTGG GGCCCCCCAA AAAAAACAAA CCCCTTTTTT TTTTAAAAAA
AAAAAATTCT TTTAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) |
|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 1 [Homo sapiens]. | 1361 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 2 [Homo sapiens]. | 1221 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 2 [Homo sapiens]. | 1221 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 2 [Homo sapiens]. | 1221 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 2 [Homo sapiens]. | 1221 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 2 [Homo sapiens]. | 1221 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform 2 [Homo sapiens]. | 1221 | 0.0 | O |
|
| ZBTB45 | zinc finger and BTB domain-containing protein 45 [Homo sapiens]. | 185 | 3e-46 | O |
|
| ZNF182 | zinc finger protein 182 isoform 2 [Homo sapiens]. | 135 | 3e-31 | O |
|
| ZNF182 | zinc finger protein 182 isoform 1 [Homo sapiens]. | 135 | 3e-31 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Zbtb20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform L [Mus musculus]. | 1345 | 0.0 | O |
|
| Zbtb20 | zinc finger and BTB domain-containing protein 20 isoform S [Mus musculus]. | 1210 | 0.0 | O |
|
| Zbtb45 | zinc finger and BTB domain-containing protein 45 [Mus musculus]. | 182 | 1e-45 | O |
|
| Zfp182 | zinc finger protein 182 [Mus musculus]. | 133 | 8e-31 | O |
|
| Zfp182 | zinc finger protein 182 [Mus musculus]. | 133 | 8e-31 | O |
|
| Zfp90 | zinc finger protein 90 [Mus musculus]. | 132 | 2e-30 | O |
|
| Zfp46 | zinc finger protein 436 [Mus musculus]. | 130 | 5e-30 | O |
|
| Zfp663 | zinc finger protein 663 [Mus musculus]. | 129 | 2e-29 | O |
|
| Zfp12 | zinc finger protein 12 [Mus musculus]. | 127 | 5e-29 | O |
|
| Gm5581 | PREDICTED: zinc finger protein 160-like [Mus musculus]. | 126 | 1e-28 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC487987 | PREDICTED: similar to Zinc finger and BTB domain containing protein 20 (Zinc finger protein 288) (Dendritic-derived BTB/POZ zinc finger protein) isoform 2 [Canis familiaris]. | 1363 | 0.0 | O |
|
| LOC487987 | PREDICTED: similar to zinc finger and BTB domain containing 20 isoform 1 [Canis familiaris]. | 1223 | 0.0 | O |
|
| LOC484222 | PREDICTED: similar to zinc finger protein 499 [Canis familiaris]. | 180 | 7e-45 | O |
|
| LOC491864 | PREDICTED: similar to zinc finger protein 21 isoform 1 [Canis familiaris]. | 135 | 3e-31 | O |
|
| LOC480899 | PREDICTED: similar to Zinc finger protein 41 [Canis familiaris]. | 134 | 4e-31 | O |
|
| LOC484540 | PREDICTED: similar to zinc finger protein 585B [Canis familiaris]. | 129 | 2e-29 | O |
|
| LOC491461 | PREDICTED: similar to zinc finger protein 551 [Canis familiaris]. | 129 | 2e-29 | O |
|
| LOC484247 | PREDICTED: similar to Zinc finger protein 208 [Canis familiaris]. | 128 | 4e-29 | O |
|
| LOC474650 | PREDICTED: similar to Zinc finger protein 208 [Canis familiaris]. | 128 | 4e-29 | O |
|
| LOC489877 | PREDICTED: similar to RB-associated KRAB repressor [Canis familiaris]. | 128 | 3e-29 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| ZBTB20 | PREDICTED: zinc finger and BTB domain containing 45-like [Bos taurus]. | 1222 | 0.0 | O |
|
| ZBTB20 | PREDICTED: zinc finger and BTB domain containing 45-like [Bos taurus]. | 1222 | 0.0 | O |
|
| ZBTB45 | PREDICTED: zinc finger and BTB domain containing 45-like [Bos taurus]. | 179 | 2e-44 | O |
|
| ZBTB45 | PREDICTED: zinc finger and BTB domain containing 45-like [Bos taurus]. | 179 | 2e-44 | O |
|
| ZNF182 | zinc finger protein 182 [Bos taurus]. | 134 | 5e-31 | O |
|
| ZNF582 | zinc finger protein 582 [Bos taurus]. | 129 | 2e-29 | O |
|
| ZNF436 | PREDICTED: KIAA1710 protein-like [Bos taurus]. | 129 | 1e-29 | O |
|
| LOC786931 | PREDICTED: zinc finger protein 585A [Bos taurus]. | 129 | 2e-29 | O |
|
| MGC134150 | PREDICTED: hypothetical protein MGC134150 [Bos taurus]. | 129 | 1e-29 | O |
|
| ZNF436 | PREDICTED: zinc finger protein 436 [Bos taurus]. | 129 | 1e-29 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC100623829 | PREDICTED: zinc finger and BTB domain-containing protein 20-like [Sus scrofa]. | 1227 | 0.0 | O |
|
| LOC100624908 | PREDICTED: zinc finger and BTB domain-containing protein 20-like [Sus scrofa]. | 774 | 0.0 | O |
|
| ZNF182 | PREDICTED: zinc finger protein 182, partial [Sus scrofa]. | 135 | 2e-31 | O |
|
| LOC100520912 | PREDICTED: zinc finger protein 436-like [Sus scrofa]. | 130 | 6e-30 | O |
|
| ZFP1 | PREDICTED: zinc finger protein 1 homolog [Sus scrofa]. | 129 | 1e-29 | O |
|
| ZNF582 | PREDICTED: zinc finger protein 582 [Sus scrofa]. | 127 | 3e-29 | O |
|
| LOC100620909 | PREDICTED: zinc finger protein 84-like [Sus scrofa]. | 127 | 5e-29 | O |
|
| LOC100520374 | PREDICTED: zinc finger protein 12-like [Sus scrofa]. | 127 | 4e-29 | O |
|
| LOC100518199 | PREDICTED: zinc finger protein 470-like [Sus scrofa]. | 126 | 7e-29 | O |
|
| LOC100518738 | PREDICTED: hypothetical protein LOC100518738 [Sus scrofa]. | 126 | 9e-29 |
20110601C-012355 : ............................................................
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