[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-013478
Length:
1,028
Sequence:
[FASTA format sequence]
GCTCCGCTCC TACTTCCTGT TTGCAACACT GTTGCTGTTG TCGACGTTAG GGGCGGTTAC
CCGAAGGCTT CCTCGGCTCT GGACGGGTTG TAAGATGCCG GGAAGAGGCC GCTGCCCCGA
TTGCGGCTCC ACTGAGCTGG TGGAAGACTC ACACTATTCG CAGAGCCAGC TGGTGTGCTC
CGACTGCGGC TGTGTGGTCA CCGAGGGAGT CCTTACGACC ACCTTCAGTG ATGAGGGCAA
CCTCCGAGAA GTAACATATT CCCGAAGCAC AGGGGAAAAT GAACAAGTTA GTCGCAGCCA
GCAACGAGGT CTCCGCCGAG TGAGAGACCT CTGTCGAGTT CTGCAGCTAC CACCAACATT
TGAGGACACG GCAGTTGCCT ACTACCAACA GGCATACCAG CACTCTGGCA TCCGTGCTGC
CAGGCTGCAA AAGAAGGAGG TGTTGGTCGG GTGCTGTGTC TTAATTACCT GCCGGCAGCG
TAACTGGCCC CTGACCATGG GAACCATCTG CACCCTAATC TATGCAGATT TGGATGTGTT
TTCTGGCACC TACATGCAGA TGGTGAAGCT CCTGGGGCTA GACGTGCCGT CTCTGTGCTT
GGCAGACCTG GTGAAGACTT ACTGTAGCAG CTTCAAACTT TTTCAAGCCT CCCCGTCTGT
GCCAGCCAAG TACGTGGAAG ACAAGGAGAA GATGCTGTCT CGAACACTGC AGCTGGTGGA
GCTGGCGGAT GAGACGTGGC TGGTGACTGG GCGGCATCCC CTACCTGTCG TTACTGCTGC
CACTTTCCTG GCCTGGCAGT CGCTGCAGCC TTCTGATCGG CTGAGTTGTT CCCTGGCCCG
ATTTTGTAAA TTGGCAAACG TGGACCTTCC CTACCCTGCT GCCTCCCGCC TGCAGGAGCT
GTTGGCCGTG CTGCTGCGGA TGGCCGGGCA GCTGGCCTGG TTGCAGGTTC TGAAGCTTGA
CAAGCGGTCT GTGGTGAAGC ACATCGGTGA CCTCCTCCAG CACCGCCACA CGCTAGTCCG
CAGGCCTT
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | BRF2 | transcription factor IIIB 50 kDa subunit [Homo sapiens]. | 597 | e-171 | O |
|
| GTF2B | transcription initiation factor IIB [Homo sapiens]. | 58.2 | 1e-08 | O |
|
| BRF1 | transcription factor IIIB 90 kDa subunit isoform 6 [Homo sapiens]. | 55.1 | 1e-07 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Brf2 | transcription factor IIIB 50 kDa subunit [Mus musculus]. | 576 | e-164 | O |
|
| Gtf2b | transcription initiation factor IIB [Mus musculus]. | 58.2 | 1e-08 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC608026 | PREDICTED: similar to RNA polymerase III transcription initiation factor BRF2 [Canis familiaris]. | 595 | e-170 | O |
|
| LOC479960 | PREDICTED: similar to Transcription initiation factor IIB (General transcription factor TFIIB) (S300-II) isoform 1 [Canis familiaris]. | 58.2 | 1e-08 | O |
|
| LOC479960 | PREDICTED: similar to general transcription factor IIB isoform 2 [Canis familiaris]. | 58.2 | 1e-08 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| BRF2 | transcription factor IIIB 50 kDa subunit [Bos taurus]. | 597 | e-171 | O |
|
| GTF2B | transcription initiation factor IIB [Bos taurus]. | 57.8 | 2e-08 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| ZFP36L2 | PREDICTED: transcription factor IIIB 50 kDa subunit [Sus scrofa]. | 500 | e-142 | O |
|
| GTF2B | PREDICTED: transcription initiation factor IIB [Sus scrofa]. | 58.2 | 7e-09 | O |
|
Assembly Members: 16
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20110601C-013478 : ............................................................
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 0
OVRT1_0018_H09.b : nnncctacgtttgcgnacgxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
PTG01_0080_B08.b : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
UTR01_0066_D10.b : gcatxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
PBL01_0029_A01.b :
PST01_0054_F01.b :
LVRM1_0192_G10.b :
LVRM1_0089_E08.b :
OVRT1_0103_B03.b : nnncccgtctgctgtg
BFLT1_0119_B10.b : nnnnccgtctgcgna
BFLT1_0099_H12.b : gaattccgtctgctgtcg
LNG01_0062_C08.b : tttttggctaggacttgacxxxxxxx
LVR01_0048_H10.b : gggtctttttttagcttagtgcxxxxxxxxxxxxxxxxx
LVR01_0044_G01.b : gggggaacatgcttcgtgantagtagacxxxxxxxx
KDN01_0099_C10.b :
PTG01_0110_G12.b : nggcgtttnnnnntt
LNG01_0078_B08.b : ttttttggacggacttg
20110601C-013478 : ..............................GCTCCGCTCCTACTTCCTGTTTGCAACACT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 30
OVRT1_0018_H09.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxGCTCCGCTCCTACTTCCTGTT*GCAACACT
PTG01_0080_B08.b : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnxxxGCTCCGCTCCTACTTCCTGTTTGCAACACT
UTR01_0066_D10.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxGCTCCGCTCCTACTTCCTGTTTGCAACACC
PBL01_0029_A01.b : aaagctgaacaxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxgAACACT
PST01_0054_F01.b : nttcgcggtggctcACACT
LVRM1_0192_G10.b : cxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
LVRM1_0089_E08.b : tcxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
OVRT1_0103_B03.b : gxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
BFLT1_0119_B10.b : cgxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
BFLT1_0099_H12.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
LNG01_0062_C08.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
LVR01_0048_H10.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
LVR01_0044_G01.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCACT
KDN01_0099_C10.b : nntttgctgcgttggctctggacCT
PTG01_0110_G12.b : gactaaagcagcggntcggntccxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxntacactg
LNG01_0078_B08.b : acxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
20110601C-013478 : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 89
OVRT1_0018_H09.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
PTG01_0080_B08.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
UTR01_0066_D10.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
PBL01_0029_A01.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
PST01_0054_F01.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
LVRM1_0192_G10.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
LVRM1_0089_E08.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
OVRT1_0103_B03.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
BFLT1_0119_B10.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
BFLT1_0099_H12.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
LNG01_0062_C08.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
LVR01_0048_H10.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
LVR01_0044_G01.b : GTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
KDN01_0099_C10.b : GTTGCTGTTN*CGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
PTG01_0110_G12.b : GTTGCTGTTGTCGACNTTAGGGGCGNGTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
LNG01_0078_B08.b : xTTGCTGTTGTCGACGTTAGGGGCG*GTTACCCGAAGGCTTCCTCGGCTCTGGACGGGTT
20110601C-013478 : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 149
OVRT1_0018_H09.b : GTAAGATGCCCGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCTCTGAGCTGGTGGAAGACT
PTG01_0080_B08.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
UTR01_0066_D10.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
PBL01_0029_A01.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
PST01_0054_F01.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
LVRM1_0192_G10.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
LVRM1_0089_E08.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
OVRT1_0103_B03.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
BFLT1_0119_B10.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
BFLT1_0099_H12.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
LNG01_0062_C08.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
LVR01_0048_H10.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
LVR01_0044_G01.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
KDN01_0099_C10.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
PTG01_0110_G12.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
LNG01_0078_B08.b : GTAAGATGCCGGGAAGAGGCCGCTGCCCCGATTGCGGCTCCACTGAGCTGGTGGAAGACT
20110601C-013478 : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 209
OVRT1_0018_H09.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
PTG01_0080_B08.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
UTR01_0066_D10.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
PBL01_0029_A01.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
PST01_0054_F01.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
LVRM1_0192_G10.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGCGGTCACCGAGGGAG
LVRM1_0089_E08.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
OVRT1_0103_B03.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
BFLT1_0119_B10.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
BFLT1_0099_H12.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
LNG01_0062_C08.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
LVR01_0048_H10.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
LVR01_0044_G01.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
KDN01_0099_C10.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
PTG01_0110_G12.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
LNG01_0078_B08.b : CACACTATTCGCAGAGCCAGCTGGTGTGCTCCGACTGCGGCTGTGTGGTCACCGAGGGAG
20110601C-013478 : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 269
OVRT1_0018_H09.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
PTG01_0080_B08.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
UTR01_0066_D10.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
PBL01_0029_A01.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
PST01_0054_F01.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACGTATTCCCGAAGCA
LVRM1_0192_G10.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
LVRM1_0089_E08.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
OVRT1_0103_B03.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
BFLT1_0119_B10.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
BFLT1_0099_H12.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
LNG01_0062_C08.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
LVR01_0048_H10.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
LVR01_0044_G01.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
KDN01_0099_C10.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
PTG01_0110_G12.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
LNG01_0078_B08.b : TCCTTACGACCACCTTCAGTGATGAGGGCAACCTCCGAGAAGTAACATATTCCCGAAGCA
20110601C-013478 : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 329
OVRT1_0018_H09.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
PTG01_0080_B08.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAAGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
UTR01_0066_D10.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
PBL01_0029_A01.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
PST01_0054_F01.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
LVRM1_0192_G10.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
LVRM1_0089_E08.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
OVRT1_0103_B03.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGGCC
BFLT1_0119_B10.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
BFLT1_0099_H12.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
LNG01_0062_C08.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
LVR01_0048_H10.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
LVR01_0044_G01.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
KDN01_0099_C10.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
PTG01_0110_G12.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
LNG01_0078_B08.b : CAGGGGAAAATGAACAAGTTAGTCGCAGCCAGCAACGAGGTCTCCGCCGAGTGAGAGACC
20110601C-013478 : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 389
OVRT1_0018_H09.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGAAGTTGCCTACTACCTAC
PTG01_0080_B08.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
UTR01_0066_D10.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
PBL01_0029_A01.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
PST01_0054_F01.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
LVRM1_0192_G10.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
LVRM1_0089_E08.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
OVRT1_0103_B03.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
BFLT1_0119_B10.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
BFLT1_0099_H12.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
LNG01_0062_C08.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
LVR01_0048_H10.b : TCAGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
LVR01_0044_G01.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
KDN01_0099_C10.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
PTG01_0110_G12.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
LNG01_0078_B08.b : TCTGTCGAGTTCTGCAGCTACCACCAACATTTGAGGACACGGCAGTTGCCTACTACCAAC
20110601C-013478 : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 449
OVRT1_0018_H09.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
PTG01_0080_B08.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
UTR01_0066_D10.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
PBL01_0029_A01.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
PST01_0054_F01.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
LVRM1_0192_G10.b : AGGCATACCAGCACTCCGGCATCCGCGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
LVRM1_0089_E08.b : AGGCATACCAGCACTCCGGCATCCGCGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
OVRT1_0103_B03.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
BFLT1_0119_B10.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
BFLT1_0099_H12.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
LNG01_0062_C08.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
LVR01_0048_H10.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
LVR01_0044_G01.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
KDN01_0099_C10.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
PTG01_0110_G12.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
LNG01_0078_B08.b : AGGCATACCAGCACTCTGGCATCCGTGCTGCCAGGCTGCAAAAGAAGGAGGTGTTGGTCG
20110601C-013478 : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 509
OVRT1_0018_H09.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
PTG01_0080_B08.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
UTR01_0066_D10.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
PBL01_0029_A01.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
PST01_0054_F01.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
LVRM1_0192_G10.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
LVRM1_0089_E08.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
OVRT1_0103_B03.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
BFLT1_0119_B10.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
BFLT1_0099_H12.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
LNG01_0062_C08.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
LVR01_0048_H10.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
LVR01_0044_G01.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
KDN01_0099_C10.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
PTG01_0110_G12.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
LNG01_0078_B08.b : GGTGCTGTGTCTTAATTACCTGCCGGCAGCGTAACTGGCCCCTGACCATGGGAACCATCT
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 569
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LVRM1_0192_G10.b : gtggcctcctcttaccgttgttactc
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 868
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PBL01_0029_A01.b : CCTTCTGATCGGCTGACTTGTTCCCTGGCCCGATTTTGTAAATTGGCAAACGTGGACCTT
PST01_0054_F01.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGTTCCCTGGCCCGATTTTGTAAAATTGGCAACGTGGACCTT
LVRM1_0192_G10.b :
LVRM1_0089_E08.b :
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BFLT1_0119_B10.b : CCTTCTGATCGGCTGACTTGTTCCCTGGCCCGATTTTGTTAATTGGCAAACGTGGACCTT
BFLT1_0099_H12.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGTTCCCCTGGCCGATTTTGTAAATTG*CAAACGTGGACCTT
LNG01_0062_C08.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGTTCCCTGGCCCGATTTTGTAAATTGGCAAACGTGGACCTT
LVR01_0048_H10.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGTTTCCTGGCCCGATTTTGTAAATTGGCAAACGTGGACCTT
LVR01_0044_G01.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGTTCCCTGGCCCGATTTTTGTAATTGGCAAACGTGGACCTT
KDN01_0099_C10.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGTTCCCTGGCCCGATTTTGTAAATTGGCAAACGTGGACCTT
PTG01_0110_G12.b : CCTTCTGATCGGCTGAGTTGGTCCCTGGCC*GATTTTGTAAATTGGGAAACGTTGAACCT
LNG01_0078_B08.b : CCTTCTGATCGGCTGACTTGTTCCCTGGCCCGATTTTGT*AATTGGCAAACGTGGACCTT
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 928
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PST01_0054_F01.b : CCCTACCCTGCTGCCTCCCGCCTGCANGAGCTGTTGGCCGTGCTGCTGCGGATGGCCGGG
LVRM1_0192_G10.b :
LVRM1_0089_E08.b :
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BFLT1_0119_B10.b : CCCTACCCTGCTGCCTCCCGCCTGCAAGAACTGTTGGCCGTGCTGCTGCGGAAGGCCGGG
BFLT1_0099_H12.b : CCCTACCCTGCTNGCTCCNG*CTGCAGGAGCTGNTGGCCGTGCTGCTGNCGATGGGCGGG
LNG01_0062_C08.b : CCCTACCCTGCTGCCTCCCGCCTGCAAGAGCTGTTGGCCGTGCTGCTGCGGATGCCCGGG
LVR01_0048_H10.b : CCCTACCCTGCTGCCTCCCCGCTGCAGGAGCTGTTGGCCGTGCTGCTGCGGATGGCCGGG
LVR01_0044_G01.b : CCCTACCCTGCTGCCTCCCGCCTGCAGGAGCTGTTGGCCGTGCTGCTGCGGATGGCCGGG
KDN01_0099_C10.b : CCCTACCCTGCTGCCCTCCGCCTGCANGAGCTGTTGGCCGTGCTGCTGCGGATGGCCGGN
PTG01_0110_G12.b : TCCTACCCTGGTGCCTTCCGCCTGCAGGAACTGTT*GCCGTGCTGCTGCGGATGGCCGGG
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 988
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LVRM1_0089_E08.b :
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1028
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