[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-001821
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1,704
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[FASTA format sequence]
GAGAGGGGGC GGGAGCGGGT TCCGGGCGGT AGGCGGGGCT TCCTTGAGGA CCCCGGGCTG
GGCGCCGCCG CCGGCTCGTC TACCCTTTCC CTCAGCAGCC TCCTTTCAAC CTTGTCCCCC
CCCCAAGCCA GCGCGGCTTC TGGGGCAGCG GCGGCGGCAG CTCCCGTTCC TGCCGCATTT
CTCTTCCCTC CTTCCCTCCC CGCCAGATCT CCGAATTCGC CTGCCATGGC CTTACTCACT
GCGGCCGCCC GGCTCTTCGG AGCCAAGAAT GCATCCTGTC TTGTTCTTGC TGCCCGGCAT
GCCAGTGCTT CTTCCACGAA CTTAAAAGAC ATTTTGGCTG ACCTGATACC TAAGGAGCAA
GCCAGAATTA AGACCTTCAG GCAGCAACAC GGCAACACCG TGGTGGGCCA AATCACTGTG
GACATGATGT ATGGTGGCAT GAGAGGCATG AAGGGATTGG TGTATGAAAC ATCGGTTCTT
GATCCTGATG AGGGCATCCG TTTCCGAGGC TACAGTATCC CTGAATGCCA GAAAATGCTG
CCCAAGGCTA AGGGTGGGGA AGAACCGCTG CCAGAGGGCT TATTTTGGCT GCTGGTAACT
GGACAGATCC CAACAGAGGA GCAGGTGTCT TGGCTCTCAA AAGAGTGGGC AAAGAGGGCA
GCTCTGCCTT CCCATGTGGT CACCATGCTG GACAACTTTC CCACGAATCT ACACCCCATG
TCTCAGCTCA GTGCAGCCAT TACAGCCCTC AACAGTGAAA GTAACTTTGC CCGAGCATAT
GCAGAGGGTA TCCACCGAAC CAAGTACTGG GAGTTGATTT ATGAAGACTG TATGGATCTG
ATCGCAAAGC TACCTTGTGT TGCAGCAAAG ATCTACCGGA ATCTCTACCG GGAGGGCAGC
AGTATTGGGG CCATTGATTC TAAACTGGAC TGGTCCCACA ATTTCACCAA CATGTTAGGC
TATACTGATG CTCAGTTCAC GGAGCTCATG CGCTTGTACC TCACCATCCA CAGTGACCAT
GAAGGTGGCA ATGTAAGTGC TCATACCAGC CATTTGGTGG GCAGTGCCCT TTCAGACCCC
TACTTGTCCT TTGCAGCAGC CATGAATGGG CTGGCAGGGC CCCTACATGG GCTGGCAAAT
CAGGAAGTGC TTGTTTGGCT GACACAGCTG CAGAAGGAAG TCGGCAAAGA TGTGTCAGAT
GAGAAGTTAC GAGACTACAT CTGGAATACA CTCAACTCAG GACGGGTTGT CCCAGGCTAT
GGCCACGCAG TACTAAGGAA GACTGATCCA CGATATACCT GTCAAAGAGA GTTTGCTCTG
AAACACCTGC CTCATGACCC CATGTTTAAG CTGGTTGCTC AGCTGTACAA GATTGTGCCC
AATGTCCTCC TGGAACAGGG CAAGGCTAAG AATCCTTGGC CCAATGTGGA TGCTCACAGT
GGGGTGCTGC TCCAGTACTA TGGCATGACG GAGATGAACT ACTACACAGT CCTGTTCGGG
GTATCACGGG CACTGGGTGT ATTAGCACAG CTCATCTGGA GCCGAGCCTT AGGCTTCCCT
CTAGAGAGGC CCAAGTCCAT GAGCACAGAC GGTCTGATAA AACTTGTGGA CTCTAAGTGA
GGGTGAAACT GAAGACTGGG AAGAAACTAA CTACCAGAAA GTGAGGGATC TTTAAAAAAA
AAAAAAAAAG TATACTTTTG TTTC
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) |
|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | CS | citrate synthase, mitochondrial precursor [Homo sapiens]. | 906 | 0.0 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Cs | citrate synthase, mitochondrial precursor [Mus musculus]. | 909 | 0.0 | O |
|
| Csl | citrate synthase-like protein [Mus musculus]. | 860 | 0.0 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC474403 | PREDICTED: similar to citrate synthase [Canis familiaris]. | 929 | 0.0 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| CS | citrate synthase, mitochondrial precursor [Bos taurus]. | 913 | 0.0 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| CS | citrate synthase, mitochondrial precursor [Sus scrofa]. | 940 | 0.0 | O |
|
| LOC100621743 | PREDICTED: citrate synthase, mitochondrial-like [Sus scrofa]. | 549 | e-156 | O |
|
| LOC100621640 | PREDICTED: citrate synthase, mitochondrial-like [Sus scrofa]. | 272 | 5e-73 | O |
|
| LOC100621942 | PREDICTED: hypothetical protein LOC100621942 [Sus scrofa]. | 66.6 | 4e-11 |
20110601C-001821 : ............................................................
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 0
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BFLT1_0149_D10.b : nnnnccgtcagcgnacgxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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PST01_0069_F01.b :
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20110601C-001821 : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 142
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BFLT1_0105_A08.b : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
BFLT1_0129_D10.b : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**C*CCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
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BFLT1_0017_A02.b : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
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BFLT1_0112_H09.b : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
TES01_0019_D03.b : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
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KDN01_0091_F10.b : CTC**GCAG*CCTCCTTTCA***CCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
BFLT1_0026_A02.b : CCTCAGCAG*CCTCCTTTCA**ACCTTGTC**CCCCCCCCAAGC*CAGCGCGG*CTTCTG
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