[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-007852
Length:
1,230
Sequence:
[FASTA format sequence]
CTGGAAGGTC CAGCCCCTAG AAGAGAGATT AGCTACAGAT TCTCCATCCT CAGTCTTTGC
AAAGGGACGG CTGTGCCAGC CAGGCTCATG CAGGCTCCTG GCAGCATGGC CATGAAGTTC
GGGGCCCTCC TGCTGGTCCT TGTGCTCAGC CTGGCACAGC CAGCCTCGGG CCGCCGGAAG
CTCCTGGTGT TTCTGCTGGA TGGTTTTCGC TCGGACTACA TCAGTGATGA GGCCCTGGAG
TCCTTGCCTG GCTTCAAAGA GATTGTGAGC AGGGGAGTAA AAGTGGATTA CTTGACCCCC
GACTTTCCTA GTCTCTCTTA TCCGAATTAC TACACCCTGA TGACCGGCCG CCATTGTGAG
GTCCATCAGA TGATCGGGAA CTACATGTGG GACCCGGCCA CCAACAAGTC ATTTGACATA
GGTGTCAACA GAGACAGCCT GATGCCTCTC TGGTGGAATG GATCAGAACC TCTGTGGATC
ACTCTGACCA AGGCCAAGAG GAAGGTTTAC ATGTACTACT GGCCAGGCTG TGAGGTTGAG
ATTCTTGGTG TCAGACCCAC TTACTGCCTA GAATATAAAA ATGTCCCAAC GGATATCAAT
TTTGCCAATG CTGTCAGCGA TGCTCTTGAC TTCTTCAAGA GCGGCCAGGC CGACCTGGCA
GCCATATACC ACGAGCGCAT TGATGTGGAA GGCCACCACT TTGGGCCCTC GTCACCACAG
AGGAGAGACG CCCTGAAGGC TGTGGACACT GTCTTGAAGT ACATGACCGA GTGGATCCAG
GAGCGAGAGC TGCAGGACGA CCTCAATGTC ATCATCTTCT CCGACCACGG CATGACAGAC
ATCTTCTGGA TGGACAAAGT GATTGAGCTG AATAAGTACA TCAGCCTGAA TGACCTGCAG
CAGGTGAAGG ACCGAGGGCC TGTTGTCAGC TTGTGGCCAG CCCCCGGGAA GCATTCCGAG
ATATATAACA AATTGAGAAG AGTTGAACAC ATGACTGTCT ATGAGAAAGA AGCCATACCG
AGCAGGTTCT ATTACAAGAA AGGAAATTTG TCTCTCCTTT GACCTTAGTG GCTGACGAAG
GATGGTTCAT AACTGAGAAT CGAGAGCTGC TTCCATTCTG GATGAACAGC ACTGGCAAGA
GGGAAGGCTG GCAGCGTGGA TGGCATGGCT ATGACAACGA CCTCCGGGAC ATGAGGGGCA
TCTTCCTGGC CTTCGGACCT GATTTTAAAT
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) |
|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | ENPP6 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 precursor [Homo sapiens]. | 601 | 0.0 | O |
|
| ENPP5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 precursor [Homo sapiens]. | 167 | 7e-50 | O |
|
| ENPP4 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 4 precursor [Homo sapiens]. | 151 | 7e-42 | O |
|
| ENPP7 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 7 precursor [Homo sapiens]. | 148 | 7e-39 | O |
|
| ENPP1 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 1 [Homo sapiens]. | 134 | 1e-35 | |
|
| ENPP3 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 3 [Homo sapiens]. | 128 | 3e-34 | |
|
| ENPP2 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 isoform 3 preproprotein [Homo sapiens]. | 118 | 1e-26 | |
|
| ENPP2 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 isoform 2 preproprotein [Homo sapiens]. | 118 | 1e-26 | |
|
| ENPP2 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 isoform 1 preproprotein [Homo sapiens]. | 95.1 | 1e-19 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Enpp6 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 precursor [Mus musculus]. | 562 | 0.0 | O |
|
| Enpp5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 precursor [Mus musculus]. | 169 | 1e-50 | O |
|
| Enpp5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 precursor [Mus musculus]. | 169 | 1e-50 | O |
|
| Enpp4 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 4 precursor [Mus musculus]. | 163 | 2e-46 | O |
|
| Enpp7 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 7 [Mus musculus]. | 147 | 1e-38 | O |
|
| Enpp3 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 3 [Mus musculus]. | 134 | 2e-35 | |
|
| Enpp1 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 1 [Mus musculus]. | 132 | 6e-35 | |
|
| Enpp2 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 isoform 2 [Mus musculus]. | 117 | 9e-31 | |
|
| Enpp2 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 isoform 1 [Mus musculus]. | 94 | 2e-19 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC475636 | PREDICTED: similar to ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 [Canis familiaris]. | 644 | 0.0 | |
|
| LOC481824 | PREDICTED: similar to ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative function) [Canis familiaris]. | 172 | 2e-51 | O |
|
| LOC479858 | PREDICTED: similar to ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 [Canis familiaris]. | 153 | 5e-44 | O |
|
| LOC481823 | PREDICTED: similar to ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (putative function) [Canis familiaris]. | 153 | 9e-43 | O |
|
| LOC608627 | PREDICTED: similar to ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 [Canis familiaris]. | 139 | 2e-37 | |
|
| LOC474820 | PREDICTED: similar to Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3 (E-NPP 3) (Phosphodiesterase I/nucleotide pyrophosphatase 3) (Phosphodiesterase I beta) (PD-Ibeta) (CD203c antigen) [Canis familiaris]. | 128 | 3e-33 | |
|
| ENPP1 | PREDICTED: similar to Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 (E-NPP 1) (Phosphodiesterase I/nucleotide pyrophosphatase 1) (Plasma-cell membrane glycoprotein PC-1) [Canis familiaris]. | 127 | 1e-33 | |
|
| LOC482026 | PREDICTED: similar to Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 (E-NPP 2) (Phosphodiesterase I/nucleotide pyrophosphatase 2) (Phosphodiesterase I alpha) (PD-Ialpha) (Autotaxin) isoform 7 [Canis familiaris]. | 120 | 7e-32 | |
|
| LOC482026 | PREDICTED: similar to Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 (E-NPP 2) (Phosphodiesterase I/nucleotide pyrophosphatase 2) (Phosphodiesterase I alpha) (PD-Ialpha) (Autotaxin) isoform 6 [Canis familiaris]. | 120 | 7e-32 | |
|
| LOC482026 | PREDICTED: similar to Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 (E-NPP 2) (Phosphodiesterase I/nucleotide pyrophosphatase 2) (Phosphodiesterase I alpha) (PD-Ialpha) (Autotaxin) isoform 4 [Canis familiaris]. | 120 | 4e-31 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| ENPP6 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 [Bos taurus]. | 644 | 0.0 | O |
|
| ENPP5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative function) [Bos taurus]. | 172 | 4e-50 | O |
|
| LOC521021 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative function)-like [Bos taurus]. | 156 | 4e-44 | O |
|
| LOC521021 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative function)-like [Bos taurus]. | 156 | 4e-44 | O |
|
| ENPP4 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 4 precursor [Bos taurus]. | 144 | 3e-40 | O |
|
| ENPP3 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 3 [Bos taurus]. | 140 | 3e-38 | |
|
| ENPP1 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 1 [Bos taurus]. | 127 | 8e-33 | |
|
| ENPP1 | PREDICTED: ecto-nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1-like [Bos taurus]. | 127 | 8e-33 | |
|
| ENPP2 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 2 precursor [Bos taurus]. | 119 | 4e-31 | |
|
| LOC788911 | PREDICTED: autotaxin, partial [Bos taurus]. | 91.3 | 2e-18 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC100152050 | PREDICTED: hypothetical protein LOC100152050, partial [Sus scrofa]. | 357 | e-104 | O |
|
| LOC100621334 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6-like [Sus scrofa]. | 197 | 1e-85 | |
|
| LOC100518435 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5-like, partial [Sus scrofa]. | 171 | 5e-44 | O |
|
| ENPP5 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 [Sus scrofa]. | 171 | 3e-50 | O |
|
| LOC100157006 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 4-like [Sus scrofa]. | 142 | 5e-40 | O |
|
| LOC100623959 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6-like [Sus scrofa]. | 141 | 9e-34 | O |
|
| LOC100621671 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 3-like [Sus scrofa]. | 133 | 9e-36 | |
|
| LOC100628173 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 3-like, partial [Sus scrofa]. | 133 | 9e-36 | |
|
| ENPP7 | PREDICTED: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 7 [Sus scrofa]. | 132 | 1e-34 | O |
|
| ENPP1 | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 1, partial [Sus scrofa]. | 130 | 8e-35 |
20110601C-007852 : ............................................................
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 0
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SPL01_0049_G02.b : nttttccattggactaanacxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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KDN01_0075_A01.b :
KDN01_0100_C01.b :
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20110601C-007852 : .....................CTGGAAGGTCCAGCCCCTAGAAGAGAGATTAGCTACAGA
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 39
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KDN01_0075_A01.b :
KDN01_0100_C01.b :
OVR01_0034_G07.b :
20110601C-007852 : TTCTCCATCCTCAGTCTTTGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 99
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SPL01_0049_G02.b : TTCTCCATCCTCAGTCTTTGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
SPL01_0024_F10.b : TTCTCCATCCTCAGTCTTTGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
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ADR01_0056_D05.b : xxxxxxxxxxxxxxxCTTTGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
OVR01_0075_D10.b : xxxxxxxxxxxxxxxxTTTGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
LNG01_0046_F05.b : xxxxxxxxxxxxxxxxTTTGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
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KDN01_0073_D01.b : tgctgctgtggctctggCTTTCAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
KDN01_0063_B08.b : nccctgcgtggctctggCTTTCAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
LNG01_0102_F03.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
LNG01_0058_B03.b : xxxxxxxxxxxxxxxxxxxGCAAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
KDN01_0075_A01.b : nnncctgcggtggctgtcttgCAAGGGACGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
KDN01_0100_C01.b : nnnnaactgctgtggctctgggcaagggaGGCTGTGCCAGCCAGGCTCATGCAGGCTCCT
OVR01_0034_G07.b :
20110601C-007852 : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 159
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SPL01_0024_F10.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LVR01_0029_C09.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0093_F08.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
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HTMT1_0002_C05.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0033_E10.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0032_G01.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0028_H02.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0091_A11.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
OVRM1_0179_F07.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0082_F04.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0077_H04.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0098_C06.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0047_C09.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
CLNT1_0079_H04.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
ADR01_0056_D05.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
OVR01_0075_D10.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
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OVRT1_0146_A08.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0006_D07.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
KDN01_0041_C02.b : GGCAGCATTGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
OVR01_0058_C11.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
KDN01_0090_F01.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
KDN01_0073_D01.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
KDN01_0063_B08.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0102_F03.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
LNG01_0058_B03.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
KDN01_0075_A01.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
KDN01_0100_C01.b : GGCAGCATGGCCATGAAGTTCGGGGCCCTCCTGCTGGTCCTTGTGCTCAGCCTGGCACAG
OVR01_0034_G07.b :
20110601C-007852 : CCAGCCTCGGGCCGCCGGAAGCTCCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCGGACTAC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 219
OVRM1_0169_D10.b : CCAGCCTCAGGCCGCCGGAAGCTCCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCGGACTAC
SPL01_0049_G02.b : CCAGCCTCGGGCCGCCGGAAGCTCCTGGTGTTTCTGCTGGGTGGTTTTCGCTCGGACTAC
SPL01_0024_F10.b : CCAGCCTCGGGCCGCCGGAAGCTCCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCGGACTAC
LVR01_0029_C09.b : CCAGCCTCGGGCCGCCGGAAGCTCCTGGTGTTTCTGCTGGATGGTTTTCGCTCGGACTAC
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