[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-007518
Length:
3,088
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[FASTA format sequence]
GCCCCTTCCA AGTGACGGCT CTGGCTGGAG AGCAGCCCTC GGTGCAGCCC CCGCTGCGGC
CGCAGCAGCT GGCCCCGCCG TACACCTACG CCCAGGGCGG CCAGCAGACC TGGGCCCCAG
AAAGACCCTT GGTGGGCGTC AACGGGCTGG ATGTGACCAG CCTGAGGCCC TTCGACCTTG
TCATCCCCTT CACCATCAAG AAGGGCGAAA TCACTGGGGA GGTGCGGATG CCCTCGGGCA
AGGTGGCGCA GCCAGCCATC ACCGACAACA AGGACGGCAC CGTGACCGTG CGCTACGCGC
CCAGTGAGGC CGGCCTGCAC GAGATGGACA TCCGCTACGA CAATATGCAC ATCCCAGGAA
GCCCCCTGCA GTTCTATGTG GATTATGTCA ACTGCGGCCA CGTCACGGCC TACGGGCCCG
GCCTCAGCCA CGGGGTGGTG AACAAGCCTG CTGTCTTCAC CGTCAACACC AAGGATGCGG
GAGAGGGAGG CTTGTCCCTG GCCATCGAGG GGCCATCCAA AGCCGAAATC AGCTGCACCG
ACAACCAAGA TGGGACGTGC AGCGTCTCCT ACCTGCCCGT GCTGCCTGGC GACTACAGCA
TCCTGGTCAA GTACAACGAG CAGCACATCC CAGGCAGCCC CTTCACGGCC AGGGTCACAG
GTGACGACTC GATGCGCATG TCCCACCTGA AAGTGGGCTC TGCCGCCGAC ATCCCCATCA
ATATCTCCGA GACGGACCTC AGCCTGCTGA CAGCCACGGT GGTGCCACCC TCAGGCCGGG
AGGAGCCCTG CCTGCTGAAG AGGCTGCGCA ATGGCCACGT GGGGATCTCG TTCGTGCCCA
AGGAGACAGG CGAGCACCTG GTGCATGTGA AGAAGAATGG CCAGCATGTG GCGAGCAGCC
CCATCCCAGT GGTGATCAGC CAGTCGGAGA TCGGGGATGC CAGCCGCGTG CGGGTCTCGG
GCCGGGGCCT CCACGAAGGC CACACCTTTG AGCCTGCAGA GTTTATCATT GACACCCGTG
ATGCAGGCTA CGGTGGGCTC AGCCTGTCCA TCGAGGGTCC CAGCAAGGTG GACATCAACA
CAGAGGACCT GGAGGATGGC ACGTGCAGGG TCACCTACTG CCCCACGGAG CCGGGCAACT
ACATCATCAA CATCAAGTTC GCCGACCAAC ACGTGCCTGG CAGCCCGTTC TCCGTGAAAG
TGACCGGTGA GGGCCGGGTG AAAGAGAGCA TCACACGCAG GCAACGGGCT CCTTCGGTGG
CTAATGTCGG CAGTCATTGC GACCTCAGCC TGAAGATCCC TGAAATTAGC ATCCAGGACA
TGACAGCCCA GGTGACCAGC CCATCAGGCA AGAGCCACGA GGCTGAGATC GTGGAAGGGG
AGAACCATAC CTACTGCATC CGCTTCGTGC CCGCTGAGAT GGGCATGCAC ACGGTCAGCG
TCAAGTACAA GGGCCAGCAC GTGCCTGGGA GCCCTTTCCA GTTCACCGTG GGGCCCCTGG
GGGAAGGGGG CGCCCACAAG GTCCGCGCCG GGGGCCCTGG CCTGGAGAGG GCTGAAGCTG
GAGTGCCAGC TGAGTTCAGC ATCTGGACCA GGGAAGCTGG CGCCGGGGGC CTGGCCATTG
CTGTTGAGGG CCCCAGCAAG GCCGAGATCT CCTTCGAGGA CCGCAAGGAC GGCTCCTGCG
GCGTGGCCTA TGTGGTCCAG GAGCCAGGTG ACTACGAGGT CTCCGTCAAG TTCAACGAGG
AGCACATCCC TGACAGCCCT TTTGTGGTGC CCGTGGCCTC TCCGTCTGGT GACGCCCGCC
GCCTTACTGT TTCTAGTCTT CAGGAGTCAG GGCTAAAGGT CAACCAGCCA GCCTCTTTTG
CAGTCAGCCT GAATGGGGCT AAGGGGGCGA TCGATGCCAA GGTGCACAGC CCCTCGGGAG
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CCGGCCCTGT GCTGCGCTCA CCTGCCTCCA CTTGGGCAAA GGAGAGAGGC GAGCAGAGGG
AGCCATTTGG TGGCCCTGCC TGTCTTCTCT GGTTCTGGGA GGGGTGAGAG GCGGGGGGTC
TTGTGCACAC CCACTCCCTA GTGCCCTTCC CTCGCCAAAA AAAAAAAAAC TGCTTTCCTT
CTCCTAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) |
|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | FLNA | filamin-A isoform 2 [Homo sapiens]. | 1758 | 0.0 | |
|
| FLNA | filamin-A isoform 1 [Homo sapiens]. | 1758 | 0.0 | |
|
| FLNB | filamin-B isoform 1 [Homo sapiens]. | 1313 | 0.0 | |
|
| FLNB | filamin-B isoform 2 [Homo sapiens]. | 1313 | 0.0 | |
|
| FLNB | filamin-B isoform 3 [Homo sapiens]. | 1309 | 0.0 | |
|
| FLNB | filamin-B isoform 4 [Homo sapiens]. | 1308 | 0.0 | |
|
| FLNC | filamin-C isoform a [Homo sapiens]. | 797 | 0.0 | |
|
| FLNC | filamin-C isoform b [Homo sapiens]. | 797 | 0.0 | |
|
| TRIM45 | tripartite motif-containing protein 45 isoform 1 [Homo sapiens]. | 52.8 | 2e-06 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Flna | filamin-A [Mus musculus]. | 1744 | 0.0 | |
|
| Flnb | filamin-B [Mus musculus]. | 1292 | 0.0 | |
|
| Flnc | filamin-C [Mus musculus]. | 798 | 0.0 | |
|
| Trim45 | tripartite motif-containing protein 45 isoform a [Mus musculus]. | 54.7 | 4e-07 | |
|
| Trim45 | tripartite motif-containing protein 45 isoform b [Mus musculus]. | 54.7 | 4e-07 | |
|
| Trim45 | tripartite motif-containing protein 45 isoform b [Mus musculus]. | 54.7 | 4e-07 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 8 [Canis familiaris]. | 1758 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 1 [Canis familiaris]. | 1758 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 2 [Canis familiaris]. | 1758 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 7 [Canis familiaris]. | 1746 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 9 [Canis familiaris]. | 1715 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 11 [Canis familiaris]. | 1715 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 10 [Canis familiaris]. | 1715 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 5 [Canis familiaris]. | 1661 | 0.0 | |
|
| LOC481084 | PREDICTED: similar to Filamin A (Alpha-filamin) (Filamin 1) (Endothelial actin-binding protein) (Actin-binding protein 280) (ABP-280) (Nonmuscle filamin) isoform 6 [Canis familiaris]. | 1549 | 0.0 | |
|
| LOC482266 | PREDICTED: similar to Filamin C (Gamma-filamin) (Filamin 2) (Protein FLNc) (Actin-binding-like protein) (ABP-L) (ABP-280-like protein) isoform 13 [Canis familiaris]. | 1360 | 0.0 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| FLNA | filamin-A [Bos taurus]. | 1766 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta isoform 4 [Bos taurus]. | 1313 | 0.0 | |
|
| FLNB | filamin-B [Bos taurus]. | 1313 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta isoform 1 [Bos taurus]. | 1313 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta isoform 7 [Bos taurus]. | 1313 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta [Bos taurus]. | 1308 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta [Bos taurus]. | 1308 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta isoform 3 [Bos taurus]. | 1308 | 0.0 | |
|
| FLNB | PREDICTED: filamin B, beta isoform 2 [Bos taurus]. | 1308 | 0.0 | |
|
| FLNC | filamin-C [Bos taurus]. | 798 | 0.0 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| FLNC | PREDICTED: filamin-C [Sus scrofa]. | 1354 | 0.0 | |
|
| FLNC | PREDICTED: filamin-C isoform 4 [Sus scrofa]. | 1354 | 0.0 | |
|
| FLNC | PREDICTED: filamin-C isoform 3 [Sus scrofa]. | 1354 | 0.0 | |
|
| FLNC | PREDICTED: filamin-C isoform 2 [Sus scrofa]. | 799 | 0.0 | |
|
| FLNC | PREDICTED: filamin-C isoform 1 [Sus scrofa]. | 799 | 0.0 | |
|
| LOC100622610 | PREDICTED: filamin-A-like, partial [Sus scrofa]. | 480 | e-135 | O |
|
| LOC100514491 | PREDICTED: filamin-B-like [Sus scrofa]. | 325 | 1e-88 | |
|
| FLNA | PREDICTED: filamin-A, partial [Sus scrofa]. | 310 | 2e-84 | O |
|
| LOC100157373 | PREDICTED: tripartite motif-containing protein 45-like isoform 1 [Sus scrofa]. | 53.5 | 7e-07 | |
|
| LOC100623212 | PREDICTED: tripartite motif-containing protein 45-like isoform 1 [Sus scrofa]. | 53.5 | 7e-07 |
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