[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-012183
Length:
1,287
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[FASTA format sequence]
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GCCGCCTACC TCTGCGGCAA GCCCGATGTG GCCATCTATG ACGGCTCCTG GTTCGAGTGG
TTCCACCGGG CTCCCCCCGG AAACCCGCGT GTCCCAGGGG AAGGGCGGGA AGGCCTGAGC
GGTGGCCTCT CCTCCCGTCG CTCACCG
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) |
|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | TST | thiosulfate sulfurtransferase [Homo sapiens]. | 549 | e-157 | O |
|
| MPST | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase isoform 2 [Homo sapiens]. | 367 | e-101 | O |
|
| MPST | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase isoform 2 [Homo sapiens]. | 367 | e-101 | O |
|
| MPST | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase isoform 1 [Homo sapiens]. | 367 | e-101 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Tst | thiosulfate sulfurtransferase [Mus musculus]. | 531 | e-153 | O |
|
| Mpst | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase [Mus musculus]. | 359 | 2e-99 | O |
|
| Mpst | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase [Mus musculus]. | 359 | 2e-99 | O |
|
| Mpst | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase [Mus musculus]. | 359 | 2e-99 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC481275 | PREDICTED: similar to thiosulfate sulfurtransferase [Canis familiaris]. | 551 | e-157 | O |
|
| LOC474515 | PREDICTED: similar to 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase [Canis familiaris]. | 369 | e-102 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| TST | thiosulfate sulfurtransferase [Bos taurus]. | 561 | e-162 | O |
|
| TST | PREDICTED: thiosulfate sulfurtransferase-like [Bos taurus]. | 561 | e-162 | O |
|
| MPST | 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase [Bos taurus]. | 380 | e-105 | O |
|
| MPST | PREDICTED: mercaptopyruvate sulfurtransferase-like isoform 2 [Bos taurus]. | 380 | e-105 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| TSTD1 | PREDICTED: thiosulfate sulfurtransferase [Sus scrofa]. | 635 | 0.0 | O |
|
| LOC100154490 | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase-like [Sus scrofa]. | 366 | e-101 | O |
20110601C-012183 : ............................GCCCACTGCTGCGGCCACTCGGAGCCCGGGCT
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 916
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TES01_0009_H06.b : CACAAAGCCCC*TCAT*TGCCACGTG*CCGGAAGGGTGTCACC*CGCTGCCACATTGCCC
LVR01_0089_E02.b : CACAAAGCCCC*TCAT*TGCCACGTG*CCGGAAGGGTGTCCCCGCCCTGCCACATTGCCC
LNG01_0002_A01.b : CACAA*GCCCC*TCAT*TGCCACGTG*CCGGAAGGGTGTCACC*GCCTGCCACATTGCCC
LNG01_0095_H03.b : CACAAA*CCCC*TCAT*TGCCACGTG*CCGGAAGGGTGTCACC**GCTTGCACATTGCCC
TCH01_0002_F03.b : CACAAAGCCCC*TCAT*TGCCACGTG*CCGGAAGGGTGTCACC*GCCTGGCACATTGCCC
LVR01_0088_F01.b : CACAAAGCCCC*TCAT*TGCCACGTG*CTGAAAGGGTGTCACC*GCCTGCCACATTGCCC
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---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 1193
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