[Overview] [RefSeq] [Assembly & SNP] [Alignment]
Assembly Name: 20110601C-012724
Length:
1,223
Sequence:
[FASTA format sequence]
TGGGAGAGAG GCTCGACATT GGCACCATGC AGATGAATTT CAGTGGTCTC CGGGCCCTGG
TGACGGGGGC AGGGAAAGGG ATCGGGCGGG ACATGGTGAA GGCCCTGCAC GTCTCAGGAG
CCAGAGTGGT GGCCGTGACC CGTACCAACG CCGACCTGGT CAGCCTCTCC CAGGAGTGCC
CAGGGATAGA GCCCGTGTGC GTGGACCTGG GCGACTGGGA GGCCACGGAG CGGGCACTGG
GTGGCGTGGG CCCCGTGGAC CTGCTGGTGA ACAACGCGGC GGTGGCGCTG ATGCAGCCCT
TCCTGGACAC CACCAAGGAG GTCTTTGACA GGTCCTTCAA CGTGAACCTG CGTTCTGTGT
TCCAGGTGTC CCAGATCGTG GCCCGGAGCA TGATCGAACG CGGAGTGCCT GGCTCCATTG
TCAATGTCTC CAGCATGGTG TCCCATGTCA CCTACCCCGG CCTAGCTGCC TACAGCTCCA
CCAAGGGCGC CATGACCATG CTGACCAAAT CCATGGCCAT GGAGCTGGGG CCACACAAGA
TCCGGGTGAA CTCCGTGAAC CCCACCGTGG TGCTGACGGC CATGGGCCGT AGTGTCACCT
CGGACCCCGA GTTAGCCCGG AAGCTGAAGG AGCGCCACCC GATGAGGAAG TTTGCAGAGG
TGGAAGACGT GGTCAACAGC ATTCTCTTCC TGCTCAGCGA CCGCAGCGCC TCCACCAGCG
GCTCGAGCAT CTTCGTGGAC GCGGGGTACC TGGCTTCCTA GAGCCAGGCG CTGGGCACCC
GGAGGGACTG CGCGCCTTCC GCTCCGCCCC GCCTCCAGAC TCGCCGGGAC CCGCCACGCC
CACCACCAAC CACGCCTCCA ACGCAGGCCA CGCCCCTCCC GCAGCTCCTC CCCCAGCGCC
CAAGGCGGTG CTTGCTGTCC CCGCTCCACC GCTTTGGCCC CACCTTCCCC GCCCCCCCCC
CGGGTTCCGC CCCAAAAGGC CTTGTTCCCT AACCCCCGCC CAGCAGGCCC CTTCCTCCCA
CCCTTTTGGG GTTTAAAACC CCGCCCCGCC CAGGAAAACC CCCCTCCCCT GGGCGCGGGC
CCCCCCCCCC TGGGCTTTCC CCCTTTCAGG GGGTTGGGGG GGGGGGATTT TTTTTCCCTT
GGAAAAAAAA AAGGGGGAGG GGCCCCCTTT TTTTCCTCCC CCTCCCCCAA AAAAAAAAAA
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA
SNP mapping information
| SNP ID | Rel. | Chr. | Location (cM) |
|---|
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
 |
 | DCXR | L-xylulose reductase isoform 1 [Homo sapiens]. | 329 | 4e-90 | O |
|
| DCXR | L-xylulose reductase isoform 2 [Homo sapiens]. | 320 | 2e-87 | O |
|
| DHRS4 | dehydrogenase/reductase SDR family member 4 [Homo sapiens]. | 114 | 2e-25 | |
|
| HSD17B8 | estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 [Homo sapiens]. | 103 | 3e-22 | O |
|
| DHRS2 | dehydrogenase/reductase SDR family member 2 isoform 2 [Homo sapiens]. | 96.7 | 4e-20 | |
|
| DHRS4L1 | putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 2 [Homo sapiens]. | 91.7 | 1e-18 | |
|
| BDH2 | 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 [Homo sapiens]. | 90.1 | 4e-18 | O |
|
| HSD17B14 | 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 [Homo sapiens]. | 88.2 | 1e-17 | O |
|
| DHRS11 | dehydrogenase/reductase SDR family member 11 precursor [Homo sapiens]. | 86.3 | 5e-17 | O |
|
| DHRS4L2 | dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 2 isoform 1 precursor [Homo sapiens]. | 77.8 | 2e-14 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| Cbr2 | carbonyl reductase [NADPH] 2 [Mus musculus]. | 416 | e-116 | O |
|
| Dcxr | L-xylulose reductase [Mus musculus]. | 314 | 1e-85 | O |
|
| H2-Ke6 | estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 [Mus musculus]. | 106 | 3e-23 | O |
|
| Dhrs4 | dehydrogenase/reductase SDR family member 4 isoform 1 [Mus musculus]. | 98.6 | 9e-21 | |
|
| Bdh2 | 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 isoform 1 [Mus musculus]. | 88.2 | 1e-17 | |
|
| Dhrs2 | dehydrogenase/reductase member 2 [Mus musculus]. | 88.2 | 1e-17 | |
|
| Bdh2 | 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 isoform 2 [Mus musculus]. | 87 | 3e-17 | O |
|
| Hsd17b14 | dehydrogenase/reductase (SDR family) member 10 [Mus musculus]. | 84 | 2e-16 | O |
|
| Cbr4 | carbonyl reductase family member 4 [Mus musculus]. | 82.8 | 5e-16 | O |
|
| Dhrs11 | dehydrogenase/reductase SDR family member 11 precursor [Mus musculus]. | 80.9 | 2e-15 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| LOC607806 | PREDICTED: similar to Lung carbonyl reductase [NADPH] (NADPH-dependent carbonyl reductase) (LCR) (Adipocyte P27 protein) (AP27) [Canis familiaris]. | 382 | e-106 | O |
|
| LOC475926 | PREDICTED: similar to dicarbonyl L-xylulose reductase [Canis familiaris]. | 303 | 3e-82 | O |
|
| DHRS4 | dehydrogenase/reductase SDR family member 4 [Canis lupus familiaris]. | 103 | 3e-22 | O |
|
| LOC607895 | PREDICTED: similar to Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 (17-beta-HSD 8) (17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8) (Protein Ke6) (Ke-6) isoform 2 [Canis familiaris]. | 102 | 6e-22 | O |
|
| LOC490616 | PREDICTED: similar to dehydrogenase/reductase (SDR family) member 2 isoform 2 [Canis familiaris]. | 95.9 | 7e-20 | |
|
| LOC478497 | PREDICTED: similar to dehydrogenase/reductase (SDR family) member 6 [Canis familiaris]. | 95.1 | 1e-19 | O |
|
| LOC490617 | PREDICTED: similar to dehydrogenase/reductase member 2 [Canis familiaris]. | 90.1 | 4e-18 | |
|
| LOC607895 | PREDICTED: similar to Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 (17-beta-HSD 8) (17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8) (Protein Ke6) (Ke-6) isoform 3 [Canis familiaris]. | 88.6 | 1e-17 | O |
|
| LOC491129 | PREDICTED: similar to short-chain dehydrogenase/reductase isoform 1 [Canis familiaris]. | 86.3 | 6e-17 | |
|
| HSD17B14 | 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 [Canis lupus familiaris]. | 80.5 | 3e-15 | O |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| DCXR | L-xylulose reductase-like [Bos taurus]. | 419 | e-117 | O |
|
| DCXR | L-xylulose reductase [Bos taurus]. | 322 | 6e-88 | O |
|
| DHRS4 | dehydrogenase/reductase SDR family member 4 [Bos taurus]. | 108 | 1e-23 | O |
|
| HSD17B8 | estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 [Bos taurus]. | 107 | 2e-23 | O |
|
| BDH2 | 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 [Bos taurus]. | 89 | 8e-18 | O |
|
| HSD17B14 | 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 14 [Bos taurus]. | 87.8 | 2e-17 | O |
|
| DHRS11 | dehydrogenase/reductase SDR family member 11 precursor [Bos taurus]. | 87.8 | 2e-17 | O |
|
| DHRS7B | dehydrogenase/reductase SDR family member 7B [Bos taurus]. | 79.7 | 5e-15 | |
|
| LOC100335501 | PREDICTED: dehydrogenase/reductase SDR family member 7B-like [Bos taurus]. | 76.6 | 4e-14 | |
|
| DECR1 | 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial [Bos taurus]. | 73.9 | 3e-13 |
| Locus | Definition | Score | E value | FL | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
|
| CBR2 | carbonyl reductase [NADPH] 2 [Sus scrofa]. | 466 | e-132 | O |
|
| HSD17B8 | estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 [Sus scrofa]. | 110 | 2e-24 | O |
|
| DHRS4 | dehydrogenase/reductase SDR family member 4 [Sus scrofa]. | 106 | 2e-23 | O |
|
| LOC100522692 | PREDICTED: 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2-like isoform 1 [Sus scrofa]. | 89.7 | 3e-18 | O |
|
| LOC100522692 | PREDICTED: 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2-like isoform 2 [Sus scrofa]. | 89.7 | 3e-18 | O |
|
| LOC100513307 | PREDICTED: dehydrogenase/reductase SDR family member 11-like [Sus scrofa]. | 87 | 2e-17 | |
|
| LOC100153608 | PREDICTED: carbonyl reductase family member 4-like [Sus scrofa]. | 83.2 | 3e-16 | O |
|
| LOC100152988 | PREDICTED: 3-ketodihydrosphingosine reductase-like [Sus scrofa]. | 72.4 | 5e-13 | |
|
| DECR1 | 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial [Sus scrofa]. | 68.6 | 7e-12 | |
|
| LOC100524293 | PREDICTED: 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2-like isoform 2 [Sus scrofa]. | 65.5 | 6e-11 |
20110601C-012724 : ............................................................
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 0
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20110601C-012724 : ..................................TGGGAGAGAGGCTCGACATTGGCACC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ 26
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20110601C-012724 : CGGGACATGGTGAAGGCCCTGCACGTCTCAGGAGCCAGAGTGGTGGCCGTGACCCGTACC
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